През 1543 г. граф Филип вече е назначил протестантски пастор в църквата "Свети Маврикий" във Висбаден. Тридесетгодишната война (1618-1648 г.) също оставя опустошителен отпечатък върху Висбаден: разрушенията и обезлюдяването са последиците, от които градът бавно се възстановява.

Георг Август Самуил, принц на Насау-Идщайн, изиграва важна роля за възстановяването на града в старите му граници.