Dès 1543, le comte Philipp avait nommé un pasteur protestant à l'église Saint-Maurice de Wiesbaden. La guerre de Trente Ans (1618-1648) a également laissé des traces dévastatrices à Wiesbaden : destruction et dépeuplement en ont été les conséquences, dont la ville ne s'est remise que lentement.

Georg August Samuel, prince de Nassau-Idstein, a largement contribué à la reconstruction de la ville dans ses anciennes limites.