تقع أمونبورغ على خط حدودي تاريخي يفصل بين مناطق مختلفة على مر القرون. ففي العصور الوسطى، كانت تمثل الحدود بين كورماينز وناسو. وفي وقت لاحق، كان هو الخط الفاصل بين دوقية هيسن الكبرى ودوقية ناسو، قبل أن يفصل ولاية هيسن الشعبية عن بروسيا في القرن العشرين.

تم بناء أول مبنى سكني في أمونبورغ في عام 1858، حيث وُلدت كاتارينا بارثيمولر في 12 مارس 1859 كأول طفلة في المنطقة التي تأسست حديثاً. وكان ذلك بداية تطور أمونيبورغ كموقع سكني وصناعي.

بدأ تطور مدينة أمونبورغ في منتصف القرن التاسع عشر في سياق التصنيع. وكانت شركة راينيشه غلاسفابريك (Rheinische Glasfabrik) من الرواد الأوائل التي تأسست هنا في عام 1852. أسس هاينريش ويوجين ألبرت مصنعًا لإنتاج الأسمدة الصناعية في عام 1861. وتبعهما فيلهلم غوستاف ديكيرهوف في عام 1864 مع ولديه غوستاف ورودولف وقاموا ببناء مصنع للأسمنت، والذي لا يزال موجوداً حتى اليوم وجلب لأموينبورغ شهرة عالمية. اجتذب نمو الصناعة المزيد والمزيد من الناس إلى أمونيبورغ.

كما جلبت الحرب العالمية الثانية الدمار إلى أمونبورغ، بما في ذلك هدم جسر كايزربروكه الذي تم افتتاحه في عام 1904. ومع ذلك فقد أعقب ذلك إعادة الإعمار وسنوات المعجزة الاقتصادية التي ضمنت النجاح الاقتصادي للشركات القائمة هنا والعيش الرغيد للسكان. استمرت البلدية في التوسع وطورت بنية تحتية حديثة.

ترجع أمونبورغ، وهي أصغر ضواحي ماينز (AKK)، إلى تاريخ خاص: كانت المنطقة في الأصل تابعة لماينز، ولكن بعد الحرب العالمية الثانية، حدد الحلفاء نهر الراين كحدود بين منطقتي الاحتلال الأمريكي والفرنسي. وقد تم تخصيص ضواحي ماينز في أمونبورغ وكاستل وكوستهايم (AKK) الواقعة على الضفة اليمنى لنهر الراين إلى فيسبادن - وهو قرار لا يزال قائماً حتى اليوم وأدى إلى ما يسمى "نزاع AKK". والآن ينظر إليها الآن بشكل فكاهي إلى حد ما في سياق الكرنفال، فإن مقولة "هناك أيضًا ماينز على الضفة اليمنى لنهر الراين" كانت موجودة بالفعل في ذلك الوقت.

يثبت حجر نذري من عام 224 ميلادي أن أمونبورغ كانت مأهولة بالفعل في العصر الروماني.