Las consecuencias higiénicas de este sistema fueron graves. En Wiesbaden, debido a las cálidas aguas termales, las condiciones de vida eran especialmente favorables para los agentes patógenos. Los molinos de grano accionados por agua situados bajo la ciudad en dirección al Rin propagaban los agentes patógenos por todas partes y constituían la mayor fuente de infección para la población. Una grave epidemia de fiebre tifoidea en 1885 marcó el punto de inflexión para Wiesbaden.

Inmediatamente después, se puso en marcha una red de alcantarillado separada para toda la ciudad, independiente de las alcantarillas de los arroyos. En principio, esta red sigue funcionando hoy en día y sólo se ha adaptado al crecimiento de la ciudad. Los aproximadamente 800 kilómetros de alcantarillado municipal recogen las aguas residuales domésticas y comerciales, las aguas pluviales y las aguas de los arroyos drenadas, así como las aguas termales, y las transportan a la depuradora principal. La estructura central del sistema de alcantarillado es el Canal Salzbach, construido en 1907 entre el Warme Damm y la depuradora principal, que transporta por separado el agua de los arroyos y las aguas residuales.