Les conséquences hygiéniques de ce système étaient graves. Cela était particulièrement sensible à Wiesbaden en raison de la chaleur de l'eau thermale, qui offre des conditions de vie particulièrement favorables aux agents pathogènes. Les moulins à céréales fonctionnant à l'eau, situés en aval de la ville en direction du Rhin, ont largement propagé les agents pathogènes et ont constitué la plus grande source d'infection pour la population. Une grave épidémie de typhus en 1885 a marqué un tournant pour Wiesbaden.

Immédiatement après, un réseau d'égouts séparé, indépendant des canaux des ruisseaux, a été mis en place dans toute la ville. En principe, ce réseau est toujours en fonction aujourd'hui et a simplement été adapté à la croissance de la ville. Les quelque 800 kilomètres de canalisations d'eaux usées de la ville recueillent les eaux usées domestiques et industrielles, les eaux de pluie et les eaux des ruisseaux captés ainsi que les eaux thermales et les évacuent vers la station d'épuration principale. L'ouvrage central du système d'égouts est le canal du Salzbach, construit en 1907 entre la digue chaude et la station d'épuration principale, qui conduit séparément les eaux de ruisseau et les eaux usées.