Le conseguenze igieniche di questo sistema erano gravi. Ciò era particolarmente evidente a Wiesbaden a causa dell'acqua termale calda, che forniva condizioni di vita particolarmente favorevoli agli agenti patogeni. I mulini per cereali alimentati ad acqua, situati sotto la città in direzione del Reno, diffondevano gli agenti patogeni in lungo e in largo e costituivano la principale fonte di infezione per la popolazione. Una grave epidemia di tifo nel 1885 segnò la svolta per Wiesbaden.

Subito dopo fu avviata una rete fognaria separata per tutta la città, indipendente dalle fognature dei torrenti. In linea di principio, questa è ancora in funzione oggi ed è stata semplicemente adattata alla crescita della città. I circa 800 chilometri di fognature comunali raccolgono le acque reflue domestiche e commerciali, l'acqua piovana e l'acqua dei torrenti drenati, nonché l'acqua termale, e le trasportano all'impianto di trattamento delle acque reflue principale. La struttura centrale del sistema fognario è il canale Salzbach, costruito nel 1907 tra il Warme Damm e l'impianto di depurazione principale, che trasporta separatamente le acque di ruscello e le acque reflue.