Regiunea din jurul Breckenheim a fost locuită de aproximativ 6.000 de ani. Descoperirile arheologice documentează așezări din epoca paleolitică. Romanii și-au lăsat și ei amprenta: un drum roman ducea de la Wiesbaden la Hofheim prin Bierstadt și Breckenheim, ceea ce indică importanța strategică a zonei.

Prima mențiune scrisă a localității Breckenheim poate fi găsită într-un document din anul 950, când regele Otto I i-a dat vasalului său Gerung mai multe proprietăți, printre care și Breckenheim. La acea dată, satul nu era încă o așezare închisă, ci era format din ferme individuale.

În Evul Mediu și la începutul epocii moderne, Breckenheim a fost distrus în mod repetat. Satul a fost lovit în mod deosebit în timpul Războiului de Treizeci de Ani, biserica suferind, de asemenea, daune considerabile.

Breckenheim a fost pentru scurt timp sediul oficial în 1776, înainte de a fi mutat la Wallau. În 1803, Breckenheim a trecut la Nassau-Usingen și mai târziu la Ducatul de Nassau. În timpul perioadei Nassau, primele drumuri au fost construite în oraș între 1831 și 1836. Cu toate acestea, această dezvoltare s-a încheiat în 1866, odată cu anexarea de către Prusia.

Sub dominația prusacă, Breckenheim a aparținut districtului Wiesbaden din districtul administrativ Hesse-Nassau. În 1928, districtul Wiesbaden a fost dizolvat, iar Breckenheim a devenit parte a districtului Main-Taunus, cu centrul administrativ în Frankfurt-Höchst. Dorința de încorporare în Wiesbaden a rămas neîmplinită, deoarece guvernul prusac a refuzat.

Breckenheim a fost ferit de distrugeri majore în timpul celui de-al Doilea Război Mondial. Construcția autostrăzii între 1936 și 1939 a divizat cartierul și parcelele au fost reorganizate. După terminarea războiului, un număr mare de familii de refugiați s-au mutat în Breckenheim, ceea ce a dus la un deficit considerabil de locuințe. Cu toate acestea, această problemă a fost depășită cu succes la începutul anilor 1950, datorită construcției intensive de locuințe.

Breckenheim a rămas un sat agricol până în anii 1950, dar agricultura nu mai era principala ocupație. Din ce în ce mai mulți locuitori din Breckenheim s-au orientat către croitorie și construcții. În special la începutul secolului, Breckenheim a devenit un centru important pentru artizanii din "Ländchen". Expansiunea orașului Wiesbaden și industrializarea au oferit oportunități suplimentare de angajare.

În anii 1960, Breckenheim a cunoscut o creștere puternică datorită poziției sale bune între Wiesbaden, Mainz și Frankfurt și a prețurilor favorabile ale proprietăților. Au fost create noi zone de construcție, iar infrastructura a fost extinsă. Breckenheim a fost încorporat în Wiesbaden în 1977, dar și-a păstrat farmecul de sat.

În 1779, a apărut primul sigiliu al Curții din Breckenheim, având ca simbol arhanghelul Mihail.