Margrethe Alexandrine Þórhildur Ingrid von Schleswig-Holstein-Sonderburg-Glücksburg 16 Nisan 1940 tarihinde Kopenhag'da doğdu. Üçüncü adı, 1944 yılına kadar İzlanda Kralı da olan büyükbabası Christian IX'a dayanmaktadır.

Danimarka anayasası 1953 yılında kadınların tahta geçmesine izin verecek şekilde değiştirildikten sonra, kraliyet tahtının varisi olarak amcası Danimarkalı Knut'un yerini aldı. Babasının 14 Ocak 1972'de ölümünün ardından ertesi gün Margarethe II adıyla Danimarka Kraliçesi ilan edildi.

20 Haziran 1974'te eşi Danimarka Prensi Henrik ile birlikte Almanya'ya yaptığı bir gezi sırasında Hessen eyaletinin başkentini ziyaret etti. Belediye Başkanı Schmitt kraliyet konuklarını belediye binasının ziyafet salonunda karşıladı. Margarethe II dostane karşılamaları için teşekkür etti ve konuşmasının merkezinde bir tur sırasında bizzat görme fırsatı bulduğu şehrin ve bölgenin güzelliğine vurgu yaptı. Kraliyet çifti daha sonra tıpkı 72 yıl önceki ataları Danimarkalı X. Christian ve İsveç ve Norveçli Oskar II gibi şehrin Altın Kitabını imzaladı.